Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclre1bQ8C7W7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms