Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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