Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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