Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep55Q8BT07 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms