Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms