Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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