Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf187Q8BFX1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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