Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna12Q80SS5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms