Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms