Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms