Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms