Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ubfd1Q78JW9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubfd1Q78JW9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubfd1Q78JW9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubfd1Q78JW9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubfd1Q78JW9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubfd1Q78JW9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ubfd1Q78JW9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ubfd1Q78JW9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ubfd1Q78JW9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ubfd1Q78JW9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubfd1Q78JW9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ubfd1Q78JW9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ubfd1Q78JW9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ubfd1Q78JW9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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