Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms