Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PD19 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PD19 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PD19 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms