Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms