Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms