Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms