Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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