Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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