Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms