Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms