Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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