Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcp1Q61233 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms