Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usf1Q61069 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usf1Q61069 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms