Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf8Q60846 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfrsf8Q60846 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfrsf8Q60846 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfrsf8Q60846 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tnfrsf8Q60846 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tnfrsf8Q60846 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf8Q60846 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms