Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms