Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms