Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Med13Q5SWW4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Med13Q5SWW4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med13Q5SWW4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Med13Q5SWW4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med13Q5SWW4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms