Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms