Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85aQ5SP85 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85aQ5SP85 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms