Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms