Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms