Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BB287469Q3UT53 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms