Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsponQ3UPR9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsponQ3UPR9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsponQ3UPR9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsponQ3UPR9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsponQ3UPR9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsponQ3UPR9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms