Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec31aQ3UPL0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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