Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms