Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skap2Q3UND0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms