Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpr55Q3UJF0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms