Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms