Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ssbp4Q3U4B1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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