Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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