Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy4Q3TYX8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms