Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shcbp1lQ3TTP0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms