Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms