Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms