Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbtb38Q3LR78 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms