Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms