Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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