Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms