Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms